Aunque España participó en las ayudas del FEDER desde el 1 de enero de 1986, sin embargo no todas las comunidades autónomas comenzaron a recibir fondos del FEDER al mismo tiempo, así la Comunidad Autónoma del País Vasco (CAPV), no comenzó a participar de las ayudas del FEDER hasta 1988, ayudas estas que se canalizan a través de: Proyectos Individuales de la "Cuota FEDER 1988" y de Programas comunitarios (STAR, VALOREN, RESIDER y RENAVAL), también se obtiene financiación a través del FSE. Por lo que respecta a Gipuzkoa, en este período recibe financiación fundamentalmente a través del Fondo Social Europeo (FSE).

No se tienen en cuenta programas comunitarios (COMETT, LEONARDO) y otras convocatorias comunitarias.